Mempertimbangkan teori perubahan, visi dan misi serta modalitas untuk mengupayakan perubahan, YKP menetapkan isu-isu strategis program dan organisasi/kelembagaan yang akan menjadi dasar atau acuan kerja selama periode 3 tahun ke depan (2023 – 2025) meliputi sebagai berikut:
I. Isu Strategis Prgram:
- Memastikan perlindungan dari kriminalisasi terhadap layanan HKSR termasuk aborsi aman. (Perlindungan di sini meliputi penyedia, pendamping dan yang memanfaatkan pelayanan).
- Pendidikan HKSR komprehensif untuk perempuan dan remaja atau kader penggerak agar dapat menjadi champion di wilayah-wilayah strategis program.
- Pengembangan media digital-social sebagai platform pembelajaran (learning platform atau virtual community).
II. Isu Strategis Organisasi/Kelembagaan:
- Penguatan dan peningkatan tata kelola (Governance) YKP sebagai organisasi gerakan/perubahan sosial dan organisasi pembelajar (learning organization) yang efektif dan akuntabel.
- Pembenahan struktur organisasi untuk peningkatan efektivitas pelaksanaan program dan kinerja.